Родился 5 октября 1922 года в Москве. Родители были актерами Вахтанговского театра. Володина мама Ксения Георгиевна Семенова была из княжеского рода Маминых, училась у самого Вахтанова, в последствии преподавала сценическую речь и стала профессором Щукинского училища. Володю воспитывала в основном мать, с отцом она рассталась. До 1936 года учился в студии А.И.Кравченко. Победил в конкурсе для одаренных детей и был определен в художественную школу при Всероссийской Академии художеств в Ленинграде (1936 – 1940 гг.), учился у А.Д.Зайцева, П.П.Казакова, А.Н.Либерова. Из-за тяжелой болезни матери ему пришлось вернуться в Москву. Он пошел работать помощником художника в Центральный театр Красной Армии. В первые месяцы Великой Отечественной войны В. Богаткин, как и многие москвичи, дежурил на крышах домов, работал на строительстве оборонительных рубежей. С конца октября 1941 года он – художник концертной бригады, созданной из актеров Вахтанговского театра. После призыва в армию – милиционер в войсках железнодорожной охраны. В тяжелые месяцы начала войны молодой художник познакомился с Михаилом Васильевичем Нестеровым (1862-1942), светлую память о котором сохранял до конца жизни. Позже В. Богаткин вспоминал: «Маститый художник очень тепло относился ко мне, и я уходил от него всегда преисполненный веры в искусство. Его критические замечания были для меня законом, и все время хотелось сделать свои рисунки как можно лучше. После возвращения к себе в часть я вновь и вновь мысленно переносился в уютную гостиную художника, где на стенах висели этюды его друзей – Левитана, Поленова, Серова – и некоторые из его полотен». В 1943 г. сделал серию зарисовок освобожденного Воронежа. В конце февраля 1944 года Владимир Богаткин был принят в Студию военных художников имени М.Б. Грекова. Первая командировка на фронт состоялась в конце марта 1944 года на 4-ый Украинский фронт, запечатлел освобождение Крыма, был на Сиваше в Бахчисарае, Севастополе, в который он входил 9 мая 1944 года вместе с войсками, штурмующими город. Затем последовали поездки на Карельский перешеек, в Румынию, Венгрию, Польшу, Германию. В последние дни войны художник рисовал на улицах Берлина, затем в Дрездене и Праге. 1 мая 1945 года он записал в своем дневнике: «Вот она победа! Победа! Победа! Горит и без того разрушенный Берлин… Ходим по улицам… и гордость за свою Родину наполняет сердца наши. Работать, работать, работать, чтобы донести историю нашим потомкам». Художник был награждён медалью "За боевые заслуги", "За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941 – 1945 гг." В 1946 году исполнил цикл литографий "По Волге" на основе зарисовок, выполненных в совместной с Н.Н.Жуковым поездке. После войны В. Богаткин не раз обращался к военной теме. В 1947 году В. Богаткин оформил спектакль «Молодая гвардия», премьера которого состоялась в феврале 1948 года на сцене театра имени Евгения Вахтангова. Художник много работал в технике литографии. На основе созданных в годы Великой Отечественной войны зарисовок исполнил серию литографий в 1946 г на тему «Штурм Берлина». В лучших листах этой серии – «Вперед к рейхстагу», «Штурм рейхстага», «Колонна победы», «Унтер ден Линден». Также известна другая его серия автолитографий – «Москва непобедимая» (1948-1949), особенно стоит отметить лист "Парад на Красной площади 7 ноября 1941 года" (1949). Исполнил серию литографий «Ленинград в дни блокады». Им созданы графические серии, посвященные также боям за Севастополь; живописное полотно «Штурм рейхстага», триптих «Юность военная» и другие. В 1950 – 1960-е годы художник побывал в творческих командировках на строительстве Волго-Донского канала, в Красноярском крае, Средней Азии, во многих уголках нашей страны и Европы, посетил Китай. Служил в Студии военных художников имени М.Б.Грекова по 1958 год. В 1958 побывал в Китае, после поездки выпустил цикл литографий "По Китаю". Делал декорации для Театра Советской армии. Работал над иллюстрациями. В 1966 году Дрезденская галерея приобрела у художника графическую серию работ о войне. Персональные выставки проводились в Москве, городах Германии, Праге. Посмертная выставка состоялась в 1972 году (к 50-летию со дня рождения) в зале СХ СССР. В 2021 году в Калужском музее изобразительных искусств прошла выставка серии произведений Владимира Богаткина, посвященная 125-летию со дня рождения маршала Советского Союза Г.К.Жукова. Работы В.В.Богаткина из собрания ГИМ были представлены в 2017 году (к 95-летию со дня рождения) и в 2022 году (к столетию со дня рождения) в Музейно-выставочном комплексе Академии акварели и изящных искусств Сергея Андрияки (Россия, Москва). Произведения Богаткина имеются в Центральном музее Великой Отечественной войны 1941 – 1945, Центральном музее Вооруженных Сил, Государственной Третьяковской галерее, Государственном Русском Музее в Санкт-Петербурге, Государственном историческом музее, Дрезденской галерее, Астраханской государственной картинной галереи им. П.М.Догадина, Рязанском государственном областном художественном музее им. И.П.Пожалостина, Белгородском государственном художественном музее, Воронежском областном художественном музее им. И.Н.Крамского, Орловском музее изобразительных искусств, Курганском областном художественном музее им. Г.А.Травникова, Чувашском государственном художественном музее, Омском областном музее изобразительных искусств им. М.А.Врубеля, Калужском музее изобразительных искусств.